Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms