Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APTXQ7Z2E3 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms