Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms