Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRI6

C15orf39, Uncharacterized protein C15orf39, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf39Q6ZRI6 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
C15orf39Q6ZRI6 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms