Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms