Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms