Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMBOX1Q6NT76 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMBOX1Q6NT76 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMBOX1Q6NT76 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMBOX1Q6NT76 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMBOX1Q6NT76 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMBOX1Q6NT76 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMBOX1Q6NT76 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMBOX1Q6NT76 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HMBOX1Q6NT76 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMBOX1Q6NT76 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMBOX1Q6NT76 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMBOX1Q6NT76 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMBOX1Q6NT76 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMBOX1Q6NT76 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMBOX1Q6NT76 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMBOX1Q6NT76 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMBOX1Q6NT76 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMBOX1Q6NT76 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMBOX1Q6NT76 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HMBOX1Q6NT76 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMBOX1Q6NT76 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMBOX1Q6NT76 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMBOX1Q6NT76 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMBOX1Q6NT76 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMBOX1Q6NT76 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMBOX1Q6NT76 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMBOX1Q6NT76 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMBOX1Q6NT76 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMBOX1Q6NT76 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMBOX1Q6NT76 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HMBOX1Q6NT76 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMBOX1Q6NT76 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMBOX1Q6NT76 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HMBOX1Q6NT76 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms