Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
INTS3Q68E01 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms