Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EEF1DP3Q658K8 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EEF1DP3Q658K8 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EEF1DP3Q658K8 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EEF1DP3Q658K8 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EEF1DP3Q658K8 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EEF1DP3Q658K8 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
EEF1DP3Q658K8 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EEF1DP3Q658K8 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
EEF1DP3Q658K8 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EEF1DP3Q658K8 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EEF1DP3Q658K8 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EEF1DP3Q658K8 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
EEF1DP3Q658K8 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EEF1DP3Q658K8 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EEF1DP3Q658K8 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EEF1DP3Q658K8 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EEF1DP3Q658K8 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EEF1DP3Q658K8 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EEF1DP3Q658K8 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms