Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms