Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms