Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms