Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms