Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms