Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms