Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms