Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms