Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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