Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms