Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms