Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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