Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Q1T7F1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Q1T7F1 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Q1T7F1 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Q1T7F1 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Q1T7F1 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Q1T7F1 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Q1T7F1 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Q1T7F1 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Q1T7F1 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Q1T7F1 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Q1T7F1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Q1T7F1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Q1T7F1 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Q1T7F1 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Q1T7F1 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Q1T7F1 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Q1T7F1 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Q1T7F1 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Q1T7F1 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Q1T7F1 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Q1T7F1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Q1T7F1 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Q1T7F1 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Q1T7F1 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Q1T7F1 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Q1T7F1 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Q1T7F1 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Q1T7F1 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Q1T7F1 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Q1T7F1 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Q1T7F1 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Q1T7F1 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Q1T7F1 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Q1T7F1 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Q1T7F1 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Q1T7F1 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Q1T7F1 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Q1T7F1 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Q1T7F1 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Q1T7F1 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Q1T7F1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Q1T7F1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Q1T7F1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Q1T7F1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Q1T7F1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Q1T7F1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Q1T7F1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Q1T7F1 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Q1T7F1 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Q1T7F1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Q1T7F1 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Q1T7F1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Q1T7F1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Q1T7F1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Q1T7F1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Q1T7F1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Q1T7F1 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Q1T7F1 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Q1T7F1 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Q1T7F1 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Q1T7F1 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Q1T7F1 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Q1T7F1 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Q1T7F1 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Q1T7F1 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Q1T7F1 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Q1T7F1 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Q1T7F1 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Q1T7F1 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Q1T7F1 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Q1T7F1 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Q1T7F1 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Q1T7F1 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Q1T7F1 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Q1T7F1 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Q1T7F1 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Q1T7F1 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Q1T7F1 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Q1T7F1 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Q1T7F1 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Q1T7F1 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Q1T7F1 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Q1T7F1 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Q1T7F1 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Q1T7F1 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Q1T7F1 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Q1T7F1 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Q1T7F1 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Q1T7F1 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Q1T7F1 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Q1T7F1 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Q1T7F1 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Q1T7F1 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Q1T7F1 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Q1T7F1 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Q1T7F1 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Q1T7F1 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Q1T7F1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Q1T7F1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
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