Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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