Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms