Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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