Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
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