Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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NFIXQ14938 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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NFIXQ14938 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
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