Protein–RNA interactions for Protein: Q14691

GINS1, DNA replication complex GINS protein PSF1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1Q14691 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GINS1Q14691 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms