Protein–RNA interactions for Protein: Q13753

LAMC2, Laminin subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC2Q13753 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LAMC2Q13753 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms