Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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