Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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