Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms