Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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