Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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