Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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PTPN13Q12923 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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PTPN13Q12923 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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