Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms