Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms