Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBQ06643 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LTBQ06643 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LTBQ06643 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LTBQ06643 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LTBQ06643 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LTBQ06643 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LTBQ06643 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LTBQ06643 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LTBQ06643 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LTBQ06643 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LTBQ06643 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LTBQ06643 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LTBQ06643 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LTBQ06643 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LTBQ06643 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LTBQ06643 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LTBQ06643 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LTBQ06643 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LTBQ06643 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LTBQ06643 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LTBQ06643 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LTBQ06643 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LTBQ06643 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LTBQ06643 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LTBQ06643 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LTBQ06643 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LTBQ06643 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LTBQ06643 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LTBQ06643 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LTBQ06643 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LTBQ06643 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LTBQ06643 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LTBQ06643 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LTBQ06643 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LTBQ06643 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LTBQ06643 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LTBQ06643 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LTBQ06643 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LTBQ06643 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LTBQ06643 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LTBQ06643 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LTBQ06643 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LTBQ06643 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LTBQ06643 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LTBQ06643 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LTBQ06643 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LTBQ06643 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LTBQ06643 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LTBQ06643 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LTBQ06643 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LTBQ06643 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LTBQ06643 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LTBQ06643 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LTBQ06643 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LTBQ06643 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LTBQ06643 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LTBQ06643 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LTBQ06643 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LTBQ06643 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LTBQ06643 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LTBQ06643 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LTBQ06643 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LTBQ06643 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LTBQ06643 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBQ06643 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBQ06643 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBQ06643 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBQ06643 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBQ06643 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBQ06643 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBQ06643 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBQ06643 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBQ06643 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBQ06643 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBQ06643 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBQ06643 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBQ06643 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBQ06643 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBQ06643 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBQ06643 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBQ06643 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBQ06643 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBQ06643 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBQ06643 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBQ06643 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBQ06643 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBQ06643 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBQ06643 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBQ06643 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBQ06643 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBQ06643 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBQ06643 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBQ06643 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBQ06643 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBQ06643 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBQ06643 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBQ06643 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBQ06643 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBQ06643 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms