Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms