Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms