Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms