Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms