Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms