Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms