Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HPCAP84074 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HPCAP84074 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HPCAP84074 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HPCAP84074 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPCAP84074 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPCAP84074 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPCAP84074 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPCAP84074 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPCAP84074 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPCAP84074 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HPCAP84074 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPCAP84074 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPCAP84074 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPCAP84074 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPCAP84074 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPCAP84074 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HPCAP84074 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPCAP84074 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPCAP84074 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPCAP84074 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPCAP84074 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPCAP84074 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPCAP84074 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPCAP84074 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HPCAP84074 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPCAP84074 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPCAP84074 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPCAP84074 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPCAP84074 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPCAP84074 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPCAP84074 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPCAP84074 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPCAP84074 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPCAP84074 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPCAP84074 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPCAP84074 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPCAP84074 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPCAP84074 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPCAP84074 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HPCAP84074 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HPCAP84074 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HPCAP84074 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
HPCAP84074 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HPCAP84074 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HPCAP84074 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HPCAP84074 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HPCAP84074 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HPCAP84074 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HPCAP84074 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HPCAP84074 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HPCAP84074 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HPCAP84074 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HPCAP84074 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HPCAP84074 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HPCAP84074 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HPCAP84074 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HPCAP84074 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HPCAP84074 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HPCAP84074 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HPCAP84074 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HPCAP84074 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HPCAP84074 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HPCAP84074 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HPCAP84074 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HPCAP84074 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HPCAP84074 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HPCAP84074 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HPCAP84074 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HPCAP84074 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HPCAP84074 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HPCAP84074 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HPCAP84074 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HPCAP84074 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HPCAP84074 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HPCAP84074 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HPCAP84074 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HPCAP84074 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HPCAP84074 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HPCAP84074 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HPCAP84074 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HPCAP84074 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HPCAP84074 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HPCAP84074 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HPCAP84074 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HPCAP84074 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HPCAP84074 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HPCAP84074 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HPCAP84074 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HPCAP84074 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HPCAP84074 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HPCAP84074 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPCAP84074 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HPCAP84074 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPCAP84074 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPCAP84074 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPCAP84074 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPCAP84074 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPCAP84074 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPCAP84074 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms