Protein–RNA interactions for Protein: P78539

SRPX, Sushi repeat-containing protein SRPX, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPXP78539 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRPXP78539 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRPXP78539 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRPXP78539 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRPXP78539 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRPXP78539 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRPXP78539 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRPXP78539 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRPXP78539 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRPXP78539 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRPXP78539 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRPXP78539 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRPXP78539 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRPXP78539 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRPXP78539 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRPXP78539 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SRPXP78539 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRPXP78539 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRPXP78539 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRPXP78539 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRPXP78539 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRPXP78539 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRPXP78539 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRPXP78539 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRPXP78539 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SRPXP78539 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRPXP78539 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRPXP78539 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRPXP78539 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRPXP78539 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRPXP78539 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRPXP78539 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRPXP78539 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRPXP78539 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRPXP78539 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRPXP78539 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SRPXP78539 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRPXP78539 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRPXP78539 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRPXP78539 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SRPXP78539 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SRPXP78539 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SRPXP78539 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRPXP78539 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRPXP78539 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SRPXP78539 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRPXP78539 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SRPXP78539 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SRPXP78539 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRPXP78539 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SRPXP78539 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SRPXP78539 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SRPXP78539 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SRPXP78539 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRPXP78539 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRPXP78539 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRPXP78539 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRPXP78539 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRPXP78539 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SRPXP78539 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SRPXP78539 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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