Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms