Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS28P62857 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS28P62857 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS28P62857 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS28P62857 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS28P62857 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS28P62857 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS28P62857 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS28P62857 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS28P62857 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS28P62857 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS28P62857 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS28P62857 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS28P62857 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS28P62857 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS28P62857 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS28P62857 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS28P62857 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS28P62857 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS28P62857 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS28P62857 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS28P62857 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS28P62857 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS28P62857 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS28P62857 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS28P62857 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS28P62857 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS28P62857 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS28P62857 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS28P62857 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS28P62857 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS28P62857 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS28P62857 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS28P62857 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS28P62857 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS28P62857 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS28P62857 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS28P62857 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS28P62857 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS28P62857 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS28P62857 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS28P62857 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS28P62857 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS28P62857 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS28P62857 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS28P62857 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS28P62857 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS28P62857 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS28P62857 MVP-202ENST00000395353 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS28P62857 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS28P62857 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS28P62857 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS28P62857 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS28P62857 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS28P62857 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS28P62857 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS28P62857 POU2F2-216ENST00000560558 3282 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS28P62857 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS28P62857 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS28P62857 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS28P62857 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS28P62857 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS28P62857 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS28P62857 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS28P62857 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS28P62857 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS28P62857 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS28P62857 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS28P62857 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS28P62857 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS28P62857 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS28P62857 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS28P62857 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS28P62857 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS28P62857 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS28P62857 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS28P62857 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS28P62857 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS28P62857 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS28P62857 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS28P62857 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS28P62857 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS28P62857 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS28P62857 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS28P62857 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS28P62857 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS28P62857 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS28P62857 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS28P62857 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS28P62857 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS28P62857 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS28P62857 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS28P62857 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS28P62857 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS28P62857 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS28P62857 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS28P62857 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS28P62857 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS28P62857 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS28P62857 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms