Protein–RNA interactions for Protein: P62820

RAB1A, Ras-related protein Rab-1A, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1AP62820 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms