Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms